Mpango wa kubuni na ufumbuzi wa mnyororo wa peptidi ya polypeptide

I. Muhtasari
Peptidi ni makromolekuli maalum kiasi kwamba mlolongo wao si wa kawaida katika sifa zao za kemikali na kimwili.Baadhi ya peptidi ni ngumu kusanisi, wakati zingine ni rahisi kusanisi lakini ni ngumu kuzisafisha.Shida ya vitendo ni kwamba peptidi nyingi huyeyuka kidogo katika miyeyusho ya maji, kwa hivyo katika utakaso wetu, sehemu inayolingana ya peptidi ya hydrophobic inapaswa kufutwa katika vimumunyisho visivyo na maji. ya taratibu za majaribio ya kibiolojia, ili mafundi wazuiliwe kabisa kutumia peptidi kwa madhumuni yao wenyewe, ili yafuatayo ni mambo kadhaa ya muundo wa peptidi kwa watafiti.

Mpango wa kubuni na ufumbuzi wa mnyororo wa peptidi ya polypeptide
Pili, uchaguzi sahihi wa peptidi za syntetisk ngumu
1. Jumla ya urefu wa mifuatano iliyodhibitiwa chini
Peptidi za chini ya mabaki 15 ni rahisi kupata kwa sababu saizi ya peptidi huongezeka na usafi wa bidhaa ghafi hupungua.Kadiri urefu wa jumla wa mnyororo wa peptidi unavyoongezeka zaidi ya mabaki 20, idadi sahihi ya bidhaa ndio jambo la msingi.Katika majaribio mengi, ni rahisi kupata athari zisizotarajiwa kwa kupunguza nambari iliyobaki chini ya 20.
2. Punguza idadi ya mabaki ya hydrophobic
Peptidi zilizo na wingi mkubwa wa mabaki ya haidrofobu, haswa katika eneo 7-12 mabaki kutoka kwa C-terminus, kwa kawaida husababisha matatizo ya syntetisk.Hii inaonekana kama mchanganyiko usiofaa kwa sababu karatasi ya B inapatikana katika usanisi."Katika hali kama hizi, inaweza kuwa muhimu kubadilisha zaidi ya mabaki mawili chanya na hasi, au kuweka Gly au Pro kwenye peptidi ili kufungua muundo wa peptidi."
3. Udhibiti wa chini wa mabaki "ngumu".
"Kuna idadi ya mabaki ya Cys, Met, Arg, na Try ambayo kwa ujumla hayakusanisi kirahisi."Ser kawaida itatumika kama mbadala isiyo na oksidi kwa Cys.
Mpango wa kubuni na ufumbuzi wa mnyororo wa peptidi ya polypeptide

Tatu, kuboresha uchaguzi sahihi wa mumunyifu katika maji
1. Rekebisha kituo cha N au C
Kuhusiana na peptidi za asidi (hiyo ni, iliyo na chaji hasi kwa pH 7), acetylation (N-terminus acetylation,C terminus kudumisha kikundi cha bure cha carboxyl) inashauriwa haswa ili kuongeza chaji hasi.Hata hivyo, kwa peptidi za kimsingi (yaani, zenye chaji chanya kwa pH 7), umiminaji (kikundi cha amino bila malipo kwenye mwisho wa N na umiminaji kwenye C-terminus) inashauriwa haswa ili kuongeza chaji chanya.

2. Futa sana au ongeza mlolongo

Baadhi ya mfuatano huo una idadi kubwa ya asidi ya amino haidrofobu, kama vile Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr na Ala, n.k. Wakati mabaki haya ya haidrofobu yanapozidi 50%, kwa kawaida si rahisi kuyeyushwa.Inaweza kuwa muhimu kurefusha mlolongo ili kuongeza zaidi fito chanya na hasi za peptidi.Chaguo la pili ni kupunguza ukubwa wa mnyororo wa peptidi ili kuongeza nguzo chanya na hasi kwa kupunguza mabaki ya haidrofobu.Kadiri pande chanya na hasi za mnyororo wa peptidi zikiwa na nguvu, ndivyo uwezekano wa kuguswa na maji unavyoongezeka.
3. Weka kwenye mabaki ya maji ya mumunyifu
Kwa baadhi ya minyororo ya peptidi, mchanganyiko wa baadhi ya asidi chanya na hasi ya amino inaweza kuboresha umumunyifu wa maji.Kampuni yetu inapendekeza N-terminus au C-terminus ya peptidi za asidi kuunganishwa na Glu-Glu.Terminus ya N au C ya peptidi ya msingi ilitolewa na kisha Lys-Ls.Ikiwa kikundi kilichochajiwa hakiwezi kuwekwa, Ser-Gly-Ser pia inaweza kuwekwa kwenye kituo cha N au C.Walakini, mbinu hii haifanyi kazi wakati pande za mnyororo wa peptidi haziwezi kubadilishwa.